OKULUN/KURUMUN TARİHÇESİ: Okulumuz 1914-1915 yılları arasında Sarayın çamaşırcı başı Kuloğlu Mustafa Bey tarafından yapılıp sonra Vakıflar Genel Müdürlüğü'ne devredilen ve Bostancı Vükela caddesinde yer alan şimdiki Halk Eğitim Merkezi Müdürlüğü'nün faaliyet gösterdiği binada eğitime başlamıştır.
Bina 1924 yılında Milli Eğitim Bakanlığına devredilmiştir. Adı geçen binada 1953 yılında meydana gelen yangın sonucu okula ait evrakların tamamı yanmıştır.
1971 yılında aynı yerde yeni bina inşa edilmiştir. 1973-1974 yılları arasında Bostancı Ortaokulu adıyla bu binada eğitim ve öğretime devam edilmiştir. 1985-1986 öğretim yılında Bostancı Ortaokulu kendi binasına taşınmıştır.
1989-1990 öğretim yılında öğrenci mevcudunun kalabalık olması nedeni ile ikili öğretime geçilmiştir. 1997 yılında Temel Eğitim 8 yıla çıkarılmış olup okulumuz Bostancı Atatürk İlköğretim Okulu adını almıştır.
2007-2008 öğretim yılına kadar İlköğretim okulu olarak hizmet veren bina 05.10.2007 tarihinde depreme karşı risk teşkil etmesinden dolayı yıkılarak İSMEP kapsamında şu anki yerinde yeniden inşa edilmiştir.
İçinde bulunduğumuz bina 22.09.2008 tarihinde eğitim ve öğretime açılmıştır. Okulumuz 2008-2009 öğretim yılında tekrar normal öğretime geçmiştir.